轻轻抛出宰相这个诱饵，朱由检再不多言。接下来的时间，不管是洪承畴还是温体仁都会成为自己的铁杆，都会拼命的表现，帮助自己力行革命。只有建立一个全新的大明，他们当宰相的理想方能实现。

不得不说，洪承畴和温体仁都是聪明绝顶能力非凡之人，接下来的时间，他们根据朱由检的提示设计出来的吏考以及吏员管理制度，越来越完善，越来越合理，考虑到了方方面面，便是朱由检都叹为观止，这都是后话了。

三路大军会剿闻香教叛军进行的非常顺利。李重镇在莱州城轻易击溃闻香教主力十多万人后，因兵力不足，只攻到了平度州，在平度州再次击败闻香教圣女和马王爷的残军之后，停下了进攻的步伐。

而赵率教却率领京师禁卫军击溃了青州府北部数支小股造反农民军后进入了莱州府境内，从潍县向南攻向胶州、即墨。

周遇吉则率领辽东禁卫军自登州城登陆，分兵攻向福山、宁海州、文登、莱阳等县。在剿灭造反农民军的同时，重点占据沿海各个卫所。

登州府三面临海，担负着海防之重任，除了在登州城修有水城炮台屯驻重兵以外，在沿海各处设立威海卫、成山卫、靖海卫、大嵩卫四个卫所，以及金山所、奇山所、崖山后所、寻山后所、宁津所等十多个千户所，海边烽墩堡垒更是上百处之多。

在账面上，整个登州府便有卫所兵十余万，不过这些只是账面上的数字而已，到了崇祯年间，绝大部分卫所兵早就沦为了农夫，不，应该说佃户或者军奴更为恰当。卫所的军田早被千户指挥们瓜分霸占完毕，卫所高级军官们一个个都成为世袭的大地主，别说普通的军户，便是好些总旗百户之类低级军官，也不得不靠给地主老爷们扛活才能维持生计。

因为军籍的限制，他们比农户更加不自由，连不当军奴的权力都没有，除非选择逃亡成为流民，而为了活命，每年逃离的军户也为数众多。

不过胆敢抵挡禁卫军的根本没有多少，大军一路清剿，也只在威海卫打了一场硬仗，先是击溃了胆敢出城迎战的叛军，然后以火炮轰破威海卫城，大军攻入城中，斩杀负隅顽抗的叛军数百，其他叛军便不战而降。

攻占卫所之后，先进行甄别，把带头叛乱的头目还有卫所将领统统抓出来杀头，至于普通的叛军，则一律用船送往辽东屯边。辽东现在地广人稀，有的是土地，这些叛军被押到辽东后先做两年苦力恕罪，然后会分给他们田地耕种。

至于没有参与卫所，禁卫军占据以后，也会把卫所将领们揪出来，以畏敌如虎、失职、侵占军田等一系列罪名抓起来充军辽东，他们霸占的军田自然也会充公。

很快朱由检派人来到登州府，宣布所有沿海卫所军户一律改为民户，军田则充为官田，分给这些普通军户耕种。从此以后，这些军户便和清田司所属其他民户一样，只需要缴纳田租，不需要再承担军役，田租的比例远低于给将领们当军奴。

这项政策一出，沿海军户们欢欣鼓舞纷纷向济南皇帝所在方向跪拜磕头，高呼万岁。

再接下来，平定叛乱的速度更加迅速了，周遇吉大军一到，各叛乱卫所纷纷归降。能分到田地过上安生日子，这些军户也不想造反。

用了两个月时间，周遇吉率军占领了登州府所有卫所，并占据了莱阳、栖霞、文登、黄县、招远、宁海、福山等州县，每个县皆屯兵千余。

而于此同时，张世泽也击败了十数支农民军，占领了胶南青州南部等州县，并在崂山击溃了闻香教最后的军队，抓住了闻香教圣女，而闻香教二头领马王爷则不知所终。

赵率教则控制了青州莱州府北部州县。

自此，遍布胶东三府的闻香教起义，只用了三个月时间，便被彻底平定。